工程保函是依据商务合同开出的，但又不依附于商务合同，是具有独立法律效力的法律文件。当受益人在保函项下合理索赔时，担保人就必须承担付款责任，而不论申请人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实，即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
预付款保函
预付款保证担保是指由保证人为施工方向业主提供的，保证人对施工方履行扣还预付款义务的保证。以防止施工方在收到业主的预付款后将款项挪作他用或宣布破产等。当施工方在规定的时间内还清预付款项后，业主就需退还预付款保函。
履约保证证明
应劳务方或投标人（申请人）的请求和业主的要求，担保人向工程的业主方（受益人）所做出的一种履约保证。倘若投标人（申请人）一旦中标，担保人有能力为中标人继续向业主提供合同履约保证，否则担保人向受益人承担赔偿责任。
农民工工资保证金保函的作用
1. 保障农民工权益：农民工工资保证金保函能够保障了农民工权益。它引入了农民工工资保证金保函，避免农民工工资拖欠，保障农民工的合法收益。
2. 办理施工许可证的必要步骤：农民工工资保证金保函是办理施工许可证的必要步骤，一般在办理施工许可证办理前办理。
3. 减轻企业压力：农民工工资保证金保函能替代建设方、施工方缴纳农民工工资保证金，减轻企业现金压力，为企业减负。
4. 防止民工工资的清欠和防欠：它是一种防止民工工资的清欠和防欠的保障措施，以第三方担保的形式来保障民工工资的正常发放，以及顾主破产情况下，可以优先权保护工人因其就业而产生的债权，以使工人能在非优先债权人获得其份额之前，从破产雇主的资产中获得偿付。