鲜活易腐货物运输中，除了少数部分货物确因途中照料或车辆不适造成死亡外，其中大多数货物都是因为发生腐烂而产生货物损坏及灭失。发生腐烂变质的主要原因：对于动物性食物来说，主要是微生物的作用。由于、霉菌和酵母在食品内的繁殖，使蛋白质和脂肪分解，变成氨、游离氮、硫化醛、硫化酮、二氧化碳等简单物质，同时产生臭气和有毒物质。此外，还使维生素受到破坏，有机酸分解，使食物腐败变质不能食用。
需要适当的通风
蔬菜、水果、动物性食物在运输过程中，都需要通风，目的是排除呼吸时放出的二氧化碳、水蒸气和热量，同时换入新鲜空气。但通风对温、湿度又有直接影响，如外界温度高，通风会提高车内温度和湿度；反之，就会下降。通风的时间也要适当，时间过短达不到换气目的，时间过长又要影响车内的温度和湿度。
保持良好的卫生条件
卫生条件不好，微生物太多，鲜活易腐货物沾染的机会多，即使温、湿度适合，食物也易于腐烂。总之，温度、湿度、通风、卫生四个条件之间既有互相配合，又有互相矛盾的关系，只有充分了解其内部规律，妥善处理好它们相互之间的关系，才能保证鲜活易腐货物的运输质量。
装运鲜活易腐货物车辆的运行组织
鲜活易腐货物具有容易腐败变质的特点，即使在规定的条件下保管和运输也仍然没有停止其腐坏的过程。因此，在铁路运输过程中除技术上需要采取特殊措施外，凡进行装车、取送、编解、挂运、加冰、加盐等作业，都应该密切配合，实行快速作业。根据我国铁路运输条件，为了保证冷藏车快速运行，除了必须建立和健全取送、预确报、编挂等制度外，还应对冷藏车的运行实行监督制度。除车站监督外，铁路分局、铁路局调度应按车号掌握冰冷藏车的运行，使每辆冷藏车从装车开始直到卸车为止，都处在集中监督之下，以便提高冷藏车运用效率。我国铁路组织鲜活易腐货物和活口车合编的快运货物列车，实行定停站点、定运行线、定编组顺序和定在站停车轨道等“四固定”制度，为加速冷藏车的运行提供了值得借鉴的经验。鲜活易腐货物卸车时，车站应把货物的状态和温度情况、卸车时间等记入“冷藏车作业单”，存站备查。遇有腐坏变质情况，车站应会同收货人检查确认腐损程度，并编制货运记录，以作调查事故判定责任的根据。