集装箱运输的初期，集装箱的结构和规格各不相同，影响了集装箱在国际上的流通，亟需制定集装箱的国际通用标准，以利于集装箱运输的发展。集装箱标准化，不仅能提高集装箱作为共同运输单元在海、陆、空运输中的通用性和互换性，而且能够提高集装箱运输的性和经济性，促进国际集装箱多式联运的发展。同时，集装箱的标准化还给集装箱的载运工具和装卸机械提供了选型、设计和制造的依据，从而使集装箱运输成为相互衔接配套、专业化和率的运输系统。集装箱标准按使用范围分，有国际标准、国家标准、地区标准和公司标准四种。
国家标准
各国政府参照国际标准并考虑本国的具体情况，而制订本国的集装箱标准。
我国现行国家标准《集装箱外部尺寸和额定重量》（GB1413-2008）中集装箱各种型号的外部尺寸、极限偏差及额定重量。
地区标准
此类集装箱标准，是由地区组织根据该地区的特殊情况制订的，此类集装箱仅适用于该地区。如根据欧洲国际铁路联盟（VIC）所制订的集装箱标准而建造的集装箱。
按用途分
有冷冻集装箱（REEFER CONTAINER），简写RF，挂衣集装箱（DRESS HANGER CONTAINER），开顶集装箱（OPEN TOP CONTAINER）简写OT，框架集装箱（FLAT RACK CONTAINER）简写FR，罐式集装箱（TANK CONTAINER）简写TK、冷藏集装箱、平台集装箱（PLATFORM CONTAINER）、通风集装箱（VENTILATED CONTAINER）、保温集装箱（INSULATED CONTAINER）。
集装箱计算单位，简称：TEU，是英文Twenty Equivalent Unit的缩写， 又称20英尺换算单位，是计算集装箱箱数的换算单位。也称国际标准箱单位。通常用来表示船舶装载集装箱的能力，也是集装箱和港口吞吐量的重要统计、换算单位。
各国大部分集装箱运输，都采用20英尺和40英尺长的两种集装箱。为使集装箱箱数计算统一化，把20英尺集装箱作为一个计算单位，40尺集装箱作为两个计算单位，以利统一计算集装箱的营运量。
在统计集装箱数量时有的一个术语：自然箱，也称"实物箱"。自然箱是不进行换算的实物箱，即不论是40英尺集装箱，30英尺集装箱，20英尺集装箱或10英尺集装箱均作为一个集装箱统计。