南航货机活体动物运输在国内外享有盛誉，其提供的专业、快速、优质、的活体动物运输服务，成活率高达99.9%甚至。

2004年南航活动物包机业务开始发展，运送15000只丹麦到郑州的水貂。当时，该货主根据以往和其他公司的合作经验，要求成活率达到成活率达95%，而南航运输成活率达到的99.9%。至今，南航已执行数十班活体包机，曾大批量地运输熊猫、种貂、种猪、种牛、鳄鱼、老虎等活体动物，如2008年5月，专机运送8只国宝大熊猫顺利飞抵北京首都国际机场；2011年上半年承运的两班次种猪包机，成活率均达到。